&

Que peut faire GraphBuilder pour vous ?

Une carte sans géographie

En permettant la représentation graphique d’objets non géographiques (sans coordonnées), GraphBuilder pour FME donne la possibilité d’explorer des jeux de données quelconques avec des logiciels d’analyse cartographique tels que Esri ArcGIS, QGIS, GvSIG, Geo… qui possèdent des propriétés intéressantes pour exploiter de gros volumes de données et assurer la classification et la représentation des données.

 

Exemple de résultat avec GraphBuilder pour FME

Prenons l’exemple du Sars-Cov2, virus célèbre pour être à l’origine de l’épidémie de COVID-19.  Le programme GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) recense les différentes souches virales identifiées depuis la découverte du premier cas en décembre 2019 et leur filiation. Le site gisaid.org propose ces données aux formats Newick (filiation) et TSV (description des souches).
Extrait de jeu de données au format Newick (source https://www.gisaid.org/)

Extrait de jeu de données au format Newick (source : www.gisaid.org)

Grâce à FME et à son extension GraphBuilder, il est possible de lire ces jeux de données, d’en constituer un graphe et d’attribuer des coordonnées à chaque souche virale pour permettre leur visualisation dans des outils SIG.

L’image ci-dessous montre un exemple de représentation sous vMap, le logiciel libre de webmapping développé par Veremes. Cette carte dynamique est disponible en ligne. Il suffit de cliquer sur un nœud du graphe pour accéder aux informations décrivant la souche virale. Cette carte est également disponible sous la forme d’un flux WMS, exploitable directement par de nombreux logiciels de cartographie.

Carte vMap "Mutations Sars-Cov2/Continent/Pays"

Carte dynamique des mutations du Sars-Cov2 par pays

 

Ressources

Jeu de données source au format Newick : à télécharger sur le site https://www.gisaid.org
Carte vMap "Mutations Sars-Cov2/Continent/Pays"
Flux WMS : https://demovmap.veremes.net/wms_fr/public/Mutation_SarsCov2

GraphBuilder pour d’autres domaines